Taksonomi ikan dan bentos

Klik 'Reference' pada toolbar utama (kanan atas aplikasi MERMAID Collect) untuk mengunduh file xlsx dari semua atribut bentik dan spesies/genus/famili ikan yang digunakan di MERMAID. Ini dapat digunakan secara offline maupun online.

Di dalam file xlsx, Anda akan menemukan lima lembar: Famili Ikan, Genera Ikan, Spesies Ikan, Pengelompokan Ikan, dan Bentos. Setiap lembar memberikan informasi untuk tingkat taksonomi tersebut. Dengan menggunakan filter, Anda dapat mencari dan menyortir informasi spesifik yang Anda cari.

Atribut ikan dan bentos di MERMAID telah distandardisasi, dan diselaraskan dengan nama-nama yang diterima di World Register of Marine Species (WoRMS), sehingga tidak ada lagi perbedaan antara data yang dimiliki oleh pengguna yang berbeda. Namun, jika Anda ingin mencatat pengamatan tentang sesuatu yang menurut Anda belum ada, Anda dapat mengusulkan untuk menambahkannya di aplikasi, dan akan ditinjau oleh tim MERMAID. Sebelum menambahkan ikan atau spesies bentik baru, pastikan Anda menggunakan nama ilmiah yang diterima oleh WoRMS.

Setelah Anda mengusulkan spesies ikan atau atribut bentik baru, Anda dapat langsung menggunakannya saat memasukkan data. Tim MERMAID akan menerima usulan Anda dan membuatnya tersedia untuk semua pengguna MERMAID lainnya, atau bekerja sama dengan Anda untuk menormalkan spesies atau atribut yang diusulkan dengan spesies atau atribut yang sudah ada; bagaimanapun juga, kami akan memberitahu Anda melalui email.

Mengusulkan spesies ikan baru

1. Di transek sabuk ikan mana pun, gulir ke bawah ke tabel Pengamatan.

2. Ketikkan spesies ikan yang ingin Anda tambahkan. Jika apa yang Anda ketik tidak sesuai dengan spesies ikan yang ada di MERMAID, pilihan untuk mengusulkan spesies baru akan muncul.

3. Klik pilihan "Propose New Species"

4. Ketikkan nama genus pada kolom Genus. Jika genus yang Anda cari tidak ada ("No results found"), kirimkan email kepada kami dengan mengklik tombol "Contact" di bagian kanan bawah aplikasi.

5. Ketikkan nama spesies pada kolom Species dan klik "Next".

6. Klik "Send to MERMAID for review" untuk melengkapi usulan Anda.

Mengusulkan atribut bentik baru

1. Dalam transek bentik mana pun, gulir ke bawah ke tabel Pengamatan

2. Ketikkan atribut bentik yang ingin Anda tambahkan. Jika apa yang Anda ketik tidak sesuai dengan atribut bentik yang ada di database kami, pilihan untuk mengusulkan atribut bentik baru akan muncul.

3. Klik pilihan "Propose New Benthic Attribute"

4. Ketikkan nama induk pada kolom Parent. Biasanya, "Parent" adalah genus atau famili karang, tetapi dapat berupa atribut non-trofik. Sebagai contoh, untuk menambahkan spesies Acropora baru bernama Acropora test, ketik / pilih Acropora di kolom Parent, kemudian ketik Acropora test di kolom Name, dan klik "Next".

5. Klik "Send to MERMAID for review" untuk menyelesaikan proposal Anda.

Hierarki taksonomi standar

MERMAID telah mengembangkan satu set hirarki taksonomi standar untuk pengamatan ikan karang dan bentik yang digunakan bersama di seluruh aplikasi MERMAID Collect, Dashboard, dan R Package. Hal ini menghilangkan pembersihan data yang panjang, menyederhanakan analisis, dan memudahkan untuk membuat bagan dan laporan yang dapat direproduksi dari data Anda;

Pengamatan ikan karang dikumpulkan dari spesies ke genus ke famili ke kelompok trofik (misalnya herbivora, planktivora, dll.);

Pengamatan bentik dikumpulkan dari spesies ke genera ke famili ke kategori tingkat atas bentik (misalnya karang keras, karang lunak, makroalga).

Pengamatan ikan karang

Untuk pengamatan ikan karang, konstanta biomassa, panjang maksimum, tingkat trofik, kerentanan penangkapan ikan, skor iklim, dan distribusi geografis diambil dari FishBase;

• Karena nilai referensi konstanta biomassa dan tingkat trofik disediakan oleh spesies di FishBase, ketika menggunakan pengamatan ikan tingkat genus atau famili di Collect, MERMAID secara otomatis akan menghitung rata-rata nilai tingkat spesies. Sebagai contoh, dengan mengetikkan "Acanth'', Anda dapat merekam pengamatan untuk famili "Acanthuridae", genus "Acanthurus", atau spesies "Acanthurus achilles"; jika Anda memilih "Acanthurus", maka nilai konstanta biomassa adalah rata-rata dari semua spesies dalam genus "Acanthurus".

Pengamatan biota laut

MERMAID menggunakan taksonomi hirarkis untuk atribut bentik. Ini berarti bahwa setiap atribut dapat 'digulung' ke dalam salah satu dari 12 kategori bentik tingkat atas yang tersedia dalam unduhan data xlsx dari MERMAID dan ditampilkan di dasbor MERMAID.

Ke-12 kategori tingkat teratas adalah:

• Substrat kosong (Bare substrate, misalnya, batu)

• Alga koralin berkerak (Crustose coralline algae)

• Sianobakteri (Cyanobacteria)

• Karang keras (Hard coral)

• Makroalga (Macroalgae)

• Lainnya (misalnya, sampah, plastik, dll)

• Invertebrata lain (Other invertebrates)

• Kerikil (Rubble)

• Pasir (Sand, termasuk lumpur)

• Lamun (Seagrass)

• Karang lunak (Soft coral)

• Ganggang rumput (Turf algae, termasuk karang mati atau karang mati dengan ganggang)

Misalnya, 'Acropora palmata' bergulir ke 'Acropora' kemudian 'Acroporidae' kemudian kategori tingkat atas terakhir 'Karang keras'. Klasifikasi kategori tingkat atas disediakan sebagai kolom terpisah dalam unduhan xlsx dari data MERMAID yang Anda kirimkan;

• Analisis khusus, seperti menghitung persentase untuk atribut bentik yang bukan merupakan kategori tingkat atas, dapat dilakukan dengan menggunakan data tingkat pengamatan dengan mengekspor data yang dikirimkan dari proyek atau mengakses secara langsung dengan menggunakan paket mermaidr.

Menggunakan filter 'blank' pada kolom Parent dari file Reference xlsx akan memberi Anda daftar 12 kategori tingkat teratas.

Memfilter atribut bentik tertentu di kolom "Parent" akan menampilkan semua atribut bentik yang menjadi miliknya.