MERMAID menyediakan referensi terpusat dan terstandardisasi untuk semua spesies ikan karang dan atribut bentik yang digunakan dalam pengumpulan dan analisis data. Referensi ini divalidasi terhadap sumber-sumber otoritatif untuk memastikan akurasi taksonomi dan konsistensi analitis di seluruh platform.
Integrasi otoritas dan sumber taksonomi
MERMAID menjaga akurasi ilmiah dengan mengandalkan basis data otoritatif berikut ini:
World Register of Marine Species (WoRMS)
Semua nama spesies ikan dan bentik di MERMAID dicocokkan dengan WoRMS untuk memastikan bahwa nama-nama tersebut secara taksonomi valid dan diterima. Hal ini mengurangi duplikasi dan memastikan konsistensi penamaan di seluruh proyek. MERMAID juga menggunakan WoRMS untuk mendapatkan distribusi geografis untuk semua atribut bentik dan ikan karang.FishBase
Untuk spesies ikan karang, MERMAID secara otomatis mengambil dan secara teratur memperbarui atribut ekologi dan biologi utama dari FishBase, termasuk:Distribusi geografis (digabungkan dengan informasi dari WoRMS)
Panjang maksimum (dalam panjang total)
Tingkat trofik
Kerentanan terhadap penangkapan ikan
Skor kerentanan iklim
Koefisien panjang-berat (a dan b) yang digunakan untuk menghitung biomassa menggunakan model panjang-berat Bayesian
Unduh file referensi taksonomi kami
Anda dapat mengakses daftar referensi lengkap secara langsung di MERMAID Collect, bahkan saat offline:
Buka MERMAID Collect.
Klik Reference pada toolbar kanan atas.
Langkah ini secara otomatis akan mengunduh sebuah file XLSX dengan referensi taksonomi terbaru untuk ikan dan atribut bentik di MERMAID.
Referensi taksonomi MERMAID diperbarui secara berkala. Untuk memastikan keakuratannya, selalu unduh versi terbaru sebelum digunakan.
Apa yang ada di dalam file Referensi
File referensi berisi 5 lembar kerja:
Famili ikan (Fish families)
Genera ikan (Fish genera)
Spesies ikan (Fish species)
Pengelompokan ikan (Fish groupings)
Bentik (Benthic)
Setiap lembar menyediakan daftar standar yang dapat difilter dari entri taksonomi yang valid dan metadatanya. Daftar ini digunakan di seluruh MERMAID Collect, Explore, dan paket R.
Tips untuk menggunakan file Referensi
Gunakan filter Excel di kolom Parent:
Pilih (Blanks) untuk melihat hanya kategori tingkat atas
Pilih parent tertentu (misal, Acropora) untuk melihat semua atribut terkait
Mengusulkan atribut bentik atau spesies ikan baru
Daftar referensi taksonomi MERMAID terus berkembang, berkat kontribusi dari para pengguna di seluruh komunitas. Ketika pengguna memasukkan pengamatan di MERMAID Collect, mereka dapat mengusulkan atribut bentik baru atau spesies ikan yang belum ada di sistem.
Setiap proposal ditinjau oleh tim MERMAID, yang memverifikasi nama tersebut dengan basis data otoritatif seperti WoRMS (untuk taksonomi) dan FishBase (untuk sifat-sifat ikan dan data ekologi). Setelah disetujui, entri baru akan ditambahkan ke basis data referensi dan tersedia untuk semua pengguna MERMAID.
Jika Anda melihat ada spesies atau atribut yang tidak ada, periksa kembali dengan basis data WoRMS untuk memastikan bahwa Anda menggunakan nama ilmiah yang diterima. Jika nama ilmiah yang diterima tidak tersedia di MERMAID, Anda dapat dengan mudah mengusulkannya saat menambahkan data Anda.
Pelajari cara melakukannya di Menambahkan unit sampel untuk mengumpulkan data.
Hierarki taksonomi standar dalam MERMAID
MERMAID menggunakan struktur hierarki terpadu untuk data ikan dan bentik di semua alat - Collect, Explore, dan paket R mermaidr. Hal ini memastikan konsistensi taksonomi, mengurangi kebutuhan pembersihan data, dan memungkinkan alur kerja analisis yang dapat direproduksi.
Hierarki ikan
MERMAID mengelompokkan pengamatan ikan karang dengan menggunakan struktur berikut:
Spesies → Genus → Famili → Kelompok trofik
contohnya, Acanthurus achilles (spesies)→ Acanthurus (genus) → Acanthuridae (famili)→ Herbivora (kelompok trofik)
Pengelompokan trofik (misalnya, planktivora, piscivora, herbivora) digunakan untuk keanekaragaman fungsional dan analisis dampak perikanan.
Ketika hanya genus atau famili yang dilaporkan, MERMAID menggunakan nilai tingkat genus/famili dari FishBase untuk menghitung konstanta rata-rata (misalnya, untuk perkiraan biomassa).
Hierarki bentik
MERMAID menggunakan struktur yang serupa untuk atribut bentik:
Spesies → Genus → Famili → Kategori tingkat atas
e.g., Acropora palmata (spesies) → Acropora (genus) → Acroporidae (famili) → Karang keras (kategori tingkat atas)
12 kategori bentik tingkat atas yang digunakan dalam MERMAID adalah:
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Kategori-kategori ini digunakan untuk menghitung komposisi tutupan bentik di seluruh lokasi dan proyek.
Mengapa hal ini penting bagi data Anda
Hirarki ini sangat penting untuk menghitung metrik kesehatan terumbu karang utama seperti:
Persentase tutupan bentik
Biomassa ikan (kg/ha) berdasarkan famili dan kelompok trofik
Dengan mengelompokkan pengamatan secara otomatis dari spesies ke kategori ekologi yang lebih luas, MERMAID memungkinkan pengguna untuk menghasilkan metrik ini bahkan ketika pengamatan dilaporkan pada tingkat taksonomi yang berbeda (misalnya, genus atau famili, bukan spesies).
Ringkasan
Semua taksonomi ikan dan bentik di MERMAID divalidasi melalui WoRMS.
Data ikan diambil secara dinamis dari FishBase, termasuk biomassa dan ciri-ciri ekologi.
Mengusulkan spesies atau atribut baru dapat dengan mudah dilakukan dalam aplikasi, dengan dukungan validasi.
Menggunakan file referensi untuk mengeksplorasi, menyaring, dan memahami pengelompokan taksonomi dengan lebih baik.
Struktur taksonomi standar MERMAID menyederhanakan analisis dan mendukung ilmu pengetahuan yang dapat direproduksi.