Mengimpor data ReefCloud ke MERMAID

Anda memiliki data foto kuadrat yang di anotasi di ReefCloud? Anda dapat mengimpornya secara langsung ke MERMAID menggunakan Easy PQT untuk mendapatkan semua data dalam satu platform.

Penting: Pastikan proyek Anda bukan proyek ujicoba (test project) dan Anda adalah Admin proyek tersebut.

Langkah-langkah untuk mengimpor data ReefCloud Anda ke MERMAID

Alur kerja untuk mengimpor data ReefCloud ke MERMAID menggunakan MERMAID Easy PQT.

Langkah 1: Siapkan proyek Anda di MERMAID Collect

Sebelum mengimpor data, Anda harus menyiapkan proyek Anda di MERMAID Collect:

  • Siapkan proyek baru (atau periksa apakah Anda memiliki proyek yang sudah ada dan siap untuk mengimpor data):

    • Tambahkan organisasi Anda.

    • Tambahkan pengguna dan tetapkan perannya.

    • Atur kebijakan berbagi data.

    • Tambahkan situs dan rezim manajemen yang terkait dengan data yang akan diimpor.

Baca lebih lanjut di Menyiapkan Proyek.

Langkah 2: Ekspor data dari ReefCloud

Ekspor data Anda dari ReefCloud menggunakan langkah-langkah di bawah ini:

  • Navigasikan ke proyek ReefCloud Anda >Export point classifications.

  • Gulir ke bawah dan hapus centang pada opsi "Only Include Human Annotatable Points" (dicentang secara default), jika perlu, atau biarkan apa adanya.

  • Klik "Export". Sebuah email dengan tautan untuk mengunduh file zip akan dikirimkan ke alamat email Anda yang terdaftar.

Penting: Anda dapat membiarkan “Only Include Human Annotatable Points” tetap tercentang (secara default) untuk mengunduh hanya titik-titik yang dapat dianotasikan oleh manusia, atau hapus centang jika Anda ingin mengunduh titik-titik yang dapat dianotasikan oleh manusia dan mesin. Pelajari lebih lanjut di Export your ReefCloud data.

Screenshot showing how to export annotations in ReefCloud as a zip file.
Ekspor anotasi ReefCloud Anda sebagai file zip. Biarkan kotak centang 'Only Include Human Annotatable Points' dicentang atau hapus centang jika diperlukan, sebelum mengklik tombol "Export".

Langkah 3: Buka MERMAID Easy PQT

  • Buka MERMAID Easy PQT

  • Easy PQT akan meminta Anda untuk mengautentikasi menggunakan kredensial MERMAID Anda.

  • Setelah login, pilih ReefCloud sebagai penyedia layanan yang Anda gunakan untuk membuat anotasi foto, kemudian daftar proyek Anda yang memenuhi syarat (non-tes) akan ditampilkan di bawah MERMAID project.

Catatan: Hanya proyek yang tidak ditandai sebagai ujicoba yang akan muncul dalam tarik-turun Select a project.

Autentikasi dengan MERMAID, pilih ReefCloud sebagai penyedia layanan yang Anda gunakan untuk membuat anotasi foto PQT, dan pilih proyek untuk mengimpor data.

Langkah 4: Pilih poin yang ingin Anda sertakan

Pilihlah:

  • "Yes, include human-annotated points only" - jika data Anda hanya berisi titik-titik yang dapat dianotasikan manusia, atau

  • "No, include human- and machine-annotated points" - jika data Anda berisi titik-titik yang dapat dianotasikan manusia dan mesin (jumlah total titik per kuadrat akan selalu 50 titik).

Pelajari lebih lanjut tentang pengambilan sampel titik di Set up your Project di ReefCloud, di bagian "Defining your point sampling approach".

Penting: MERMAID Easy PQT akan memprioritaskan anotasi manusia (diambil dari kolom “Point Human Classification”). Jika tidak ada data dalam kolom tersebut, maka kami akan menggunakan anotasi mesin (dari kolom “Point Machine Classification”).

Langkah 5: Unggah file yang diekspor

  • Pilih proyek yang ingin Anda impor datanya.

  • Unggah file Anda dengan mengeklik Browse atau seret dan letakkan file Anda ke dalam modal unggah. Hanya file ZIP yang diekspor dari ReefCloud yang dapat dibaca oleh Easy PQT.

Unggah file ZIP yang diekspor dari ReefCloud ke MERMAID Easy PQT.

Langkah 6: Cocokkan label ReefCloud ke atribut bentik MERMAID

  • MERMAID Easy PQT secara otomatis mencocokkan label ReefCloud ke atribut bentik dan/atau bentuk pertumbuhan MERMAID. Anotasi manusia diprioritaskan (dari kolom "Point Human Classification"). Jika tidak ada, maka anotasi mesin (dari kolom "Point Machine Classification") akan digunakan sebagai gantinya.

  • Label yang belum ditetapkan akan muncul dalam warna merah di bagian atas tabel. Klik dan ketik atau gunakan menu tarik-turun untuk menetapkan atribut bentik dan/atau bentuk pertumbuhan yang tepat.

Catatan: Anda dapat membiarkan kolom MERMAID growth form kosong, namun kolom MERMAID benthic attribute merupakan kolom yang wajib diisi.

Setelah semua label ditetapkan dan ditinjau agar sesuai dengan atribut bentik MERMAID yang valid, Anda dapat mengklik tombol "Confirm" untuk melanjutkan proses impor.

Tinau dan sesuaikan label yang dicocokkan untuk memastikan bahwa semua label ReefCloud sesuai dengan atribut bentik dan/atau bentuk pertumbuhan MERMAID yang valid.

Langkah 7: Tinjau dan impor data ke MERMAID

  • Setelah data Anda diformat ulang dan divalidasi, klik Import data.

  • Alternatif lain, Anda dapat memulai ulang dengan mengklik tombol Restart Easy PQT atau mendapatkan bantuan dengan mengklik tombol Get help jika ada yang tidak sesuai.

  • Anda juga dapat mengunduh set data yang diformat ulang sebagai CSV dengan mengeklik tombol "Download reshaped data" di bagian kanan atas tabel.

  • Setelah proses pengimporan selesai, Anda akan menerima pesan konfirmasi di layar Anda: Import successful!

  • Anda dapat menutup jendela atau menggulir ke bawah dan mengklik Go to MERMAID Collect untuk menyelesaikan proses impor di MERMAID Collect.

Catatan: Data yang sudah diformat ulang masih memiliki data yang perlu dilengkapi (yaitu kedalaman, panjang transek, dan ukuran kuadrat) di MERMAID Collect. Ekspor data yang sudah lengkap dan bersih melalui halaman Submitted dalam proyek Anda.

Periksa kembali data Anda sebelum melakukan finalisasi, lalu lanjutkan dengan proses impor ke MERMAID.

Langkah 8: Lengkapi unit sampel di MERMAID Collect

  • Buka halaman Collecting di proyek Anda.

  • Lengkapi kolom yang diperlukan: kedalaman (depth), panjang transek (transect length), dan ukuran kuadrat (quadrat size).

  • Verifikasi informasi observer. MERMAID akan secara otomatis menugaskan Anda sebagai observer. Anda bisa mengganti observer jika orang lain yang mengumpulkan data.

Setelah impor selesai, data Anda dapat diakses sebagai unit sampel di halaman Collecting. Lengkapi metadata yang diperlukan dan submit unit sampel yang telah divalidasi.
  • Validasi setiap unit sampel.

  • Submit setiap unit sampel yang telah divalidasi.

  • Setelah di submit, unit sampel tersedia untuk semua pengguna proyek di halaman Submitted.

Catatan: Data yang diimpor akan muncul di halaman Collecting akun Anda pada proyek yang dituju. Jika perlu, Admin proyek dapat mengirimkan seluruh unit sampel ke pengguna lain dari halaman Users pada proyek yang sama. Pelajari lebih lanjut di Mengedit data.

Apakah Anda lebih suka alur kerja berbasis kode di R?

Untuk pengguna R, lihat Mengimpor Data Lama ke MERMAID.